就在王树亭他们在悄悄准备的时候。
朝廷和起义军的动作也不断。
朝廷方面，一面严令陕西各地官军卫所出兵进剿贼寇，又拨出银两来安抚榆林、延绥、宁夏、固原等镇的边军，一面问询缴贼策略，时有，左副都御史杨鹤上言:“图治之要，在培元气。自大兵大役，加派频仍，公私交罄，小民之元气伤;自辽左、黔、蜀丧师失律，暴骨成丘，封疆之元气伤;自搢绅构党，彼此相倾，逆奄乘之，诛锄善类，士大夫之元气伤。譬如重病初起，百脉未调，风邪易入，道在培养。“
又正赶上三边总督武之望病死，群臣就推荐了杨鹤接任三边总督，崇祯皇帝召见杨鹤询问他的治贼方略，杨鹤回答到：“清慎自持，抚恤将卒而已。”
崇祯皇帝也深以为然，以为那些农民军只不过是疥癣之疾罢了，只要把那些兵变的士兵招抚住贼人很快就可以扑灭，于是便任命杨鹤代理陕西三边总督，督三边军务负责剿贼事宜。
要说这时候的官军还真是有点东西的，要是天天饿着又不给钱，那谁还给你做事，只要是给足了粮饷打起仗来也全然是不含糊，而且装备优势也在，虽然现在工部将作坊等等那些家伙偷工减料，但也只是对高精尖的武器，你想三眼火铳、大将军炮这一类的，官军士兵们都不怎么爱使。
虽然那玩意威力大，但是毛病就是容易炸膛，真要是运气不好，没杀敌呢就先把自己崩了！
但是对于盔甲和刀枪等兵器做工还是很好的，很多人都觉得这时候的明军装备差，那怎么可能呢，先不说各级将领的家丁部队，那都是刀马俱全，身上带着短火铳，手持长枪，身上披着双层或者三层战甲，这冲入敌阵那就是人形的小坦克。
就是那些普通的募兵部队，披甲率也达到了八成左右。那就更别提精锐的边军了，尤其是东北一带的边军。
之所以陕西闹起来后，有那么多的城池被攻陷，一方面是由于边军哗变造成了大批的官兵转身就变成了反贼，他们手里可是都有着精良的武器装备，用来攻击守备力量薄弱的县城还是很轻松的。
其二的原因就是，这些地方的兵民全都快吃不上饭了，县官都恨不得一天三顿喝稀得，官仓里是有粮食，但那不是官员们可以私自动用的。
真正能够吃饱饭的则是那些地主、士绅大族，不管外边什么样子，他们还依旧是锦衣玉食。
这人们就不愿意了，怎么个意思，我们饿的都快死了，还要守城防备贼寇，你们倒是窝在城里安心的吃喝玩乐，去你娘的，老子也不干了，贼人冲进城来爱谁谁反正先抢的是你们，更有甚者直接就去开城门直接成了起义军中一员。
这也使得陕西的起义军很快的就以边军为骨，老百姓为肉的壮大起来。
杨鹤到任之后，安抚边军还是起到了很大作用，从榆林镇，宁夏三卫抽调部队，配合这地方卫所部队对起义军进行围剿，很快就剿灭了一些起义军，不过其中也存在着不小的问题。
杨鹤其人，虽然很清明自爱，但是他不知兵，军事行动上全听领兵将领的，对这些部队又缺乏足够的威慑力，这样就造成了要么将领养寇自重捞军饷物资，要么比起义军还黑，打下一个地方之后就开始大肆敛财，杀人放火的事情也没少做，百姓们更是怨声载道，匪过如梳兵过如篦这可不是说着玩玩的。
等杨鹤到达陕西的时候，王大梁、周大旺、王二等已经被陕西卫所官兵诛灭，以为形势开始好转，不由得再加大了对反叛官兵的招降力度，和对各地起义军的围剿。越围剿百姓受的苦就越多，甚至有的地方百姓听到官军来了自己就先跑了。
这一闹腾就折腾到了崇祯二年的秋天，这一年不仅兵灾没有过去，陕西的干旱还变的更加严重了，本来应该能很快剿灭的陕西农民起义，反而弄的越来越大。
在四月二十六日奉命巡视陕西灾情的马懋才奏报给皇帝的奏折中写道：“臣乡延安府，去年全年无雨，草木枯焦，民争采山间蓬草为食。蓬草尽，则剥树皮而食。树皮尽，则掘山中石块而食，石性冷而味腥，少食辄饱，不数日则腹胀下坠而死。饥民相聚为“盗”，与其坐等饥死，不如为“盗”而死。又烧人骨为薪，煮人肉以为食者，而食人之人，不数日即面目赤肿，燥热而死。于是，死枕藉，臭气熏天，安塞县城外掘数坑，每坑可容数百人，不及掩埋者，又不知还有多少？小县如此，大县可知，一处如此，他处可知。百姓又安得不相牵而为“盗”。而庆阳、延安以北，饥荒更甚。”
大灾之下的百姓就是起义军最好的沃土，很快起义军就从要被扑灭的小火苗变成了燎原之火。
这时候还发生了影响整个陕西甚至整个大明的严重事件：清军入关了！后金兵入关！
十月二十七日，后金军兵分三路侵略大明，一路攻打入大安口，参将周镇战死；一路攻入龙井关，一路攻打洪山口，参将张安德等败逃，张万春降，蓟州被围。
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