曹操说：“孙权小儿这是想要把我放在炉炭上啊！”
司马懿对答说：“汉朝的国运将要终结，您十分天下而有其九，还臣服听命于汉。
如今孙权称臣，是顺应天人之意。”
建安二十四年（219年），司马懿升任太子中庶子，佐助魏太子曹丕。
当时司马懿每次参与谋划，都有奇策，所以为曹丕所信任和重用，
与陈群、吴质、朱铄[shuò]并称“四友”。
司马懿转任军司马，建议屯田解决粮食问题，得到曹操的采纳。
他指出荆州刺史胡修粗暴，南乡太守傅方骄奢，都不应驻守边防，曹操未予重视。
同年八月，汉水流域因为天降暴雨而发生了“汉水溢流，害民人”的自然灾害。
关羽趁机乘船进攻，擒于禁、斩庞德。胡、傅二人果然乘机降蜀。
因汉献帝在许昌，距樊城很近，曹操感到威胁，
为避关羽锋芒，一度准备迁都黄河以北。
司马懿和曹椽蒋济及时劝阻说：“于禁被大水所淹，不是战守上的失误，
对于国家的大局并没有大损失，为此而迁都，即是向敌人示弱，
又会使淮河、汉水一带人心不稳；刘备、孙权外亲内疏，如今关羽坐大，
孙权必定不安，把这件事告知孙权，使他牵制关羽，则樊城之围自解。”
曹操从其计，孙权果然派吕蒙袭取公安，关羽被其俘杀。
之后曹操认为荆州遗民及在颍川屯田的军民逼近南方的敌对势力，想把他们迁走。
司马懿认为：“荆楚之民大多轻脱，轻易移动怕是难以安定。
如今关羽刚刚被击破，藏窜逃亡者也在观望时局。如今将那里的人迁徙，
既伤当地人的心意，也令想要回来的人不敢复还。”
曹操听了他的建议，没有移民。之前藏窜逃亡者果然都复出归化。
建安二十五年正月庚子日（220年3月15日），曹操去世，朝野危惧，
司马懿管理丧葬诸事，内外肃然，并奉曹操梓宫回到邺城。
同年，曹丕即魏王位，司马懿受封河津亭侯，转丞相长史。
当时孙权正率军向西。朝臣们认为樊城、襄阳缺乏粮，不能抵御吴军，
请召守将曹仁回驻宛城（今河南南阳宛城区）。
司马懿则表示：“孙权刚刚打败关羽，正是他想和魏国结好的时候，一定不敢为患。
襄阳是水陆交通要地，不能放弃。”曹丕没听其建议，命曹仁放火烧毁二城。
后来孙权果然没来入侵。曹丕悔之不及。
黄初元年十月辛未日（220年12月11日），曹丕篡汉，建立曹魏。
曹丕登基后，任命司马懿为尚书，不久转督军、御史中丞，封安国乡侯。
黄初二年（221年），免去督军官职，升任侍中、尚书右仆射。
黄初五年（224年），曹丕伐吴，临江观兵。司马懿奉命镇守许昌，
并改封司马懿为向乡侯，转抚军、假节，领兵五千，加给事中、录尚书事。
司马懿力辞不受，曹丕说：“朕夜以继日处理国家大事，
没有须臾片刻的休息时间。如今册封你不是加以优荣，而是要你为我分忧。”
黄初六年（225年），曹丕再次大兴舟师伐吴，命司马懿留守许都，
对内镇抚百姓，对外为大军提供军资。
临行，曹丕下诏给司马懿说：“我担心后勤和朝内之事，所以将这些大事委托给你。
曹参虽多有战功，但是萧何在后方的支持才更为重要。
如今你留守后方，使我无西顾之忧，这可行吗！”
之后曹丕由广陵（今江苏省扬州市广陵区）回师京都，
又下诏对司马懿说：“我向东用兵孙权，你该总理京都洛阳的事情；
我在洛阳，你则应当总理东征孙权的战事。”
于是又命司马懿留镇许昌。
黄初七年（226年）五月，曹丕病重。
临终时，令司马懿与中军大将军曹真、镇军大将军陈群、征东大将军曹休为辅政大臣。
曹丕对太子曹叡说：“在这里的三位重臣，一定不要怀疑他们。”
曹叡即位，改封司马懿为舞阳侯。孙权得知魏文帝去世后，于八月出兵攻魏。
命诸葛瑾、张霸兵分两路进攻襄阳，
亲自率军进攻江夏郡（治石阳县，即今武汉市黄陂西南）。
司马懿击退了孙权，又击败诸葛瑾，并斩杀张霸，斩首千余级。
十二月，司马懿升任骠骑将军。
太和元年（227年）六月，魏明帝曹叡命司马懿驻扎宛城，
加督荆、豫二州诸军事。蜀将孟达降魏时，魏待其甚厚，
司马懿认为他言行倾巧，不可信任。但曹叡不听，
任命孟达领新城（今湖北省房县）太守。曹丕死后，孟达失宠，
蜀丞相诸葛亮即暗中与之通信，图谋叛魏。诸葛亮恐他言行反复无常，
想促他速叛，知魏兴太守申仪和他有矛盾，便派郭模到申仪处诈降，有意泄露其事。
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